กรดนิวคลีอิกแบบเกลียวคู่ประกอบด้วยลำดับคู่เสริม ซึ่งการจับคู่เบสของวัตสัน-คริก อย่างกว้างขวางส่งผลให้เกิด โครงสร้างสามมิติแบบเกลียวคู่ของกรดนิวคลีอิกที่ค่อนข้างสูงและสม่ำเสมอ ในทาง ตรงกันข้าม กรดนิวคลีอิก โมเลกุล RNA และ DNA สายเดี่ยวไม่ถูกจำกัดด้วยเกลียวคู่ปกติ และสามารถนำโครงสร้างสามมิติที่ซับซ้อนสูง มาใช้ ซึ่งอิงตามลำดับช่วงสั้น ๆ ของลำดับเบสในโมเลกุล รวมทั้งวัตสัน-คริกและ noncanonical คู่เบส และปฏิสัมพันธ์ระดับอุดมศึกษาที่ซับซ้อนที่หลากหลาย