แตงกวายังเต็มไปด้วยสารต้านอนุมูลอิสระ  Melink กล่าว เช่นเดียวกับอาหารจากพืชอื่นๆ แตงกวาอัดแน่นไปด้วยสารประกอบจากพืชหรือโพลีฟีนอล โดยเฉพาะลิกแนนและคิวเคอร์บิทาซิน สารประกอบจากพืชเหล่านี้ต่อสู้กับอาการอักเสบทั่วร่างกายรวมถึงอนุมูลอิสระซึ่งอาจเป็นสาเหตุของโรคเรื้อรัง แตงกวา เช่น โรคหัวใจและมะเร็ง บทความหนึ่งที่ตีพิมพ์ใน International Journal of Health Sciencesพบว่า cucurbitacins ไม่เพียงแต่มีประสิทธิภาพในการฆ่าเซลล์มะเร็งเท่านั้น แต่ยังป้องกันการแพร่กระจายไปทั่วร่างกายอีกด้วย